Pythagorio ansluter Samos med Egeiska öarna, Dodekanisos & Ikaria med överfarter till Fournoi (i Egeiska öarna), Agathonisi, Arkoi, Patmos, Lipsi, Leros, Kalymnos, Kos, Symi, Rhodos & Astypalea (i Dodekanisos) & Ayios Kirikos (i Ikaria). Res från Pythagorio körs av ett antal olika färjor.
Det är upp till 12 överfarter dagligen från Pythagorio med en resetid från 35 minuter. Vår Pythagorio sammanfattning är en bra guide men för vår senaste information gällande tidtabeller och priser, använd får biljettsökning.